Recentemente desenvolvido por cientistas, um novo software pode vir a ajudar pacientes diagnosticados com leucemia linfoblástica aguda a determinar qual subtipo da doença que eles possuem.
A leucemia linfoblástica aguda é o tipo de cancro infantil mais comummente diagnosticado no mundo.
“Entre 35% a 40% de todos os cancros infantis diagnosticados são leucemia linfoblástica aguda – esta é uma doença muito problemática na área da oncologia pediátrica”, explica Paul Ekert, um dos cientistas envolvidos neste trabalho.
Todos os anos, mais de 300 pessoas são diagnosticadas com leucemia linfoblástica aguda – mais da metade são crianças com menos de 15 anos. Determinar qual subtipo de leucemia linfoblástica aguda que um paciente tem fornece informações valiosas sobre seu o prognóstico e sobre a forma como eles devem ser tratados.
“Descobrir quais as alterações genéticas que causam o cancro de um paciente é a chave para descobrir o quão intenso deve ser o tratamento e quais os fármacos a serem usados”.
Mas até ao aparecimento das tecnologias genómicas, como o sequenciamento de RNA, os métodos existentes não eram muito precisos.
“Até aqui, as anomalias genéticas eram detetadas através de um microscópio, onde se observava cromossomas individuais e se procurava por quatro ou cinco defeitos principais – hoje em dia, sabemos que existem, pelo menos, 23 subtipos para a leucemia linfoblástica aguda”.
Num artigo publicado na revista Blood Advances, investigadores da Universidade de Melbourne, do Murdoch Children’s Research Institute e do Children’s Cancer Institute, todos na Austrália, falaram do ALLSorts, um software que usa dados de sequenciamento de RNA para identificar o subtipo leucemia linfoblástica aguda de um paciente.
“O ALLSorts adiciona uma maneira diferente de encontrar esses drivers genéticos e classificar o subtipo de leucemia linfoblástica aguda que um paciente tem. Este software pode ser usado até mesmo com uma única amostra de paciente, de modo que os centros de testes, independentemente do seu tamanho, poderão usá-lo”.
De acordo com os cientistas, o ALLSorts também é a primeira ferramenta disponível publicamente e de código aberto.
“Usamos uma abordagem de aprendizado de máquina e validámos a precisão do nosso software em amostras de cancro infantil do Royal Children’s Hospital e em amostras de cancro em adultos do Instituto Peter Mac”.
Com este software, é o computador que reúne todas as informações de um grande conjunto de dados para usar os recursos mais informativos do conjunto de dados, em vez de depender dos investigadores humanos para determinar quais são as partes importantes dos dados.
“Esperamos que este software possa ser usado em todo o mundo para testar leucemia linfoblástica aguda e informar-nos sobre as opções de tratamento para os pacientes. Este trabalho é um bom exemplo da importância da biologia computacional na pesquisa do cancro.”
Fonte: Medical Xpress
